而在很多時候，肥胖，僅僅為疾病的其中一種表現，或常與其他疾病並見。例如多囊卵巢綜合征(PCOS)是一種常見的婦科疾病，在臨床上以雄激素過高、持續無排卵、卵巢多囊改變為特徵，常伴有胰島素抵抗和肥胖。對於這種情況，必須辨證和辨病相結合，掌握疾病的特點，肥胖型多囊卵巢綜合征屬中醫“不孕”範疇，病機為痰虛阻滯、脾虧腎虛，致使血瘀、氣瘀、痰濕。其治療原則為祛瘀活血、補腎健脾。中醫治療是從對人的內分泌調理入手，在整體調節機體的內分泌功能的同時辨證施治，配合針灸治療，內服外治，以求長遠根本療效。

治療其他很多與肥胖並見的疾病，也是同樣需要須辨證和辨病相結合的， 例如糖尿病，其中腹型肥胖與代謝綜合征、胰島素抵抗密切相關；或是肥胖相關性腎病、脂肪肝、高血壓、心臟病、高膽固醇、糖尿病、腦血管病、膽囊病、骨關節炎、睡眠窒息症等。基本上以“急者治標，緩者治本”為原則，並先以治療最緊急、危重的疾病為主，其次才是以減肥減重。